EL EDIFICIO ISTMO-COMANDANCIA es uno de los edificios más antiguos de La Línea de la Concepción , construido entre 1863 y 1865, destinado a los Jefes y Oficiales de la guarnición militar. Asimismo, constituye el nacimiento de La Línea de la Concepción, ya que los primeros asentamientos de civiles lo protagonizaron personas al servicio de su guarnición militar. Fue construido con sillares del Fuerte de Santa Bárbara.
En la actualidad alberga dependencias de la Delegación de Cultura como el Archivo Histórico Municipal "Francisco Tornay", la Biblioteca Pública Municipal "José Riquelme" o la Sala de Exposiciones Temporales Istmo-Comandancia.
El Museo del Istmo es hoy día uno de los mayores centros de exposiciones de la zona. Cuenta con un fondo fotográfico de más de 2000 negativos, Cartoteca municipal, grabados y pirograbados, conchas y corales del litoral gaditano.
En sus innumerables salas, se presentan al visitante una serie de muestras nacionales e internacionales de diversos temas de interés.
En algunas de sus salas se presentan exposiciones itinerantes, principalmente de pintura, escultura y colecciones particulares.
En el Archivo Museo Histórico Municipal puede encontrarse junto a una magnífica biblioteca de temas históricos, maquetas, utensilios y herramientas.