El pequeño Paraje Natural Estuario del Río Guadiaro de San Roque, al este del Parque Natural del Estrecho y de la Bahía de Algeciras, ocupa el propio estuario y una isla central formada con los sedimentos arrastrados por el río, en el corazón de Sotogrande Costa. Siendo actualmente el único humedal que posee el litoral oriental gaditano, es un área de singular geomorfología y de gran riqueza faunística, sobre todo de aves. Pues, su emplazamiento, que coincide con una de las rutas más importantes de las aves migratorias, hace que sea un lugar de tránsito bastante concurrido en los meses de verano. Se han contabilizado hasta 140 especies distintas.
Por todo ello, este enclave ha sido declarado Zona de Especial interés para las Aves. Entre las que pueden observarse, destacan la garceta común, la garza real e imperial, águila pescadora, espátulas y flamencos, entre otras muchas. En cuanto a fauna piscícola hay que resaltar la existencia de la lamprea marina.
La vegetación presente es la propia de estas zonas húmedas, aunque con dominio de carrizos. No obstante, en las áreas no inundables algunos acebuches se intercalan con tojos y zarzas.
El paraje natural cuenta con dos rutas con pasarelas para conocer el espacio, una en el Paseo del Parque y la otra en la calle Jaime el Conquistador, justo después de la glorieta.